「戦国時代最強の水軍」と謳われた村上水軍。
海賊である彼らは、主家毛利氏の命を受け、石山本願寺を助けるため織田水軍と対決することに。
一見、不利な戦いに見えたが、彼らには織田水軍を破るある秘策があり…？